轮虫利用其它的方法维持了健康基因和有活力的谱系。其中一个就是基因转换(gene conversion),即通过DNA修复机制或是其他策略用一个等位基因替换另外一个。另一种策略是水平基因转移(HGT),将来自一个生物体的DNA 转移到另一个生物体,这一机制在微生物中常见,但在动物中却很少见到。至少有8%的轮虫基因有可能是通过HGT获得,这比任何其他的动物都多。轮虫却不同寻常,它们可以脱水达数周或数月,当重新获得水时可以恢复生命力。在这一脱水的阶段,它们的DNA会断裂成许多的碎片。当它们补充水份时,有可能是一个机会,将来自摄入细菌、真菌或微藻的外源DNA片段转移到了轮虫的基因组中。
更为重要的是,这有可能为轮虫整合来自另一个轮虫的基因提供了机会。作者们认为,如果它需要通过基因转换来获取基因以修复损伤基因,这将是非常有用的。“突变和DNA修复过程以这种方式模拟了性的某些方面,”Mark Welch说。
另一个惊人的研究发现是,蛭形轮虫基因组中转座子的数量极低,“这些被称作为‘遗传寄生物’的DNA片段有时候能够在基因组中四处移动,引起有害突变。尽管转座子构成了大约50%的哺乳动物基因组,它们却只占轮虫基因组的3%,并且它们的扩增能力似乎非常有限。这为轮虫提供了一层大多数动物没有的保护来避免突变。
无性繁殖的问题是所有后代的基因都与母亲相同。从本质上讲,这是近亲繁殖的终极形式,除了减数分裂期间偶尔出现的复制错误,没有办法创造更多的遗传多样性。因此,无性繁殖的动物更容易受到寄生虫、疾病和环境波动的影响,缺乏基因多样性来应对这些问题。 有性生殖物种约出现在100万~200万年前,而无性生殖的物种历史很少超过10万年,或者至少理论上如此。但蛭形轮虫公然蔑视了这一预测。她们成功的秘诀之一似乎是能够从其他生命形式“窃取”基因,这很可能是通过其食物实现的。这些外来基因可能造就了蛭形轮虫另一种超常能力:对干旱和极强辐射的抵抗力。蛭形轮虫的遗传物质整合了外来基因,能够编码修复断裂DNA的酶。窃取基因和重建基因组的过程可能为蛭形轮虫提供了与有性生殖一样的演化优势。 大部分科学家认为,只有通过有性繁殖才有可能形成更加适应环境的新物种,而无性繁殖则不可能使物种进化。蛭形轮虫无性繁殖的发现,推翻了动物需要通过交配来创造生物多样性的理论。甚至有科学家表示,蛭形轮虫等无性繁殖生物的进化,是生物进化的一个必然趋势。英国帝国理工学院生物学家巴尔克劳博士说:“这是一个令人兴奋的发现,它将为今后的科学研究提供一个新的角度。”
最早的单细胞生物出现在35亿年前,与多细胞生物相比,单细胞生物在地球上生存的时间要久远得多,其以非常快的繁殖能力形成生物群落和生物圈。单细胞生物虽然只由一个细胞构成,但能完成营养、呼吸、排泄、运动、生殖和调节等生命活动,并且也能处理复杂的信息并做出相应的决策。蛭形轮虫虽然是无性繁殖,但其单基因断裂后,又能重新整合。
蛭形轮虫谱系中的 vag 旋轮虫栖息于经常遭受干旱的临时生境中。最近公布的 vag 旋轮虫基因组草图显示出一种独特的基因组结构,这种结构与减数分裂不兼容,这表明干燥诱导的 DNA 损伤可能重塑了这些生物的基因组结构。然而,迄今为止,轮虫中 DNA 损伤与干燥之间的因果关系从未得到证实。为了验证干燥诱导 DNA 双链断裂(DSB)这一假说,我们开发了一种方案,可使干燥后的 vag 旋轮虫具有较高的存活率。我们使用脉冲场凝胶电泳来监测基因组完整性,追踪干燥蛭形轮虫中 DSB 的发生情况,并观察到这些断裂随着在脱水状态下所经历的时间而积累。这些 DSB 在重新水化后会逐渐修复。即使基因组被质子辐射完全粉碎成小的 DNA 片段,vag 旋轮虫个体仍能够从干燥状态中有效恢复并修复大量 DSB。有趣的是,在研究紫外线 A 和紫外线 B 照射对干燥蛭形轮虫基因组完整性的影响时,我们观察到这些天然辐射也会导致重要的 DNA DSB,这表明在干燥阶段基因组并未受到保护,但这些有趣的生物中的修复机制极其高效。
物遗传物质 DNA的遗传保守性是维持生物物种相对稳定的最主要因素。然而,在长期的生物演进过程中,生物体时刻受到来自内、外环境中各种因素的影响,DNA 的改变不可避免。各种体内外因素所导致的 DNA 组成与结构变化称为 DNA 损伤(DNA damage)。DNA 损伤可产生两种后果:一是损伤导致 DNA 的结构发生永久性改变,即突变;二是损伤导致 DNA失去作为复制和(或)转录的模板的功能。
在长期的生物进化中,无论低等生物还是高等生物均形成了自己的 DNA 损伤修复系统,可随时修复损伤的 DNA,恢复 DNA 的正常结构,保持细胞的正常功能。实际上,DNA 损伤的同时即伴有DNA 损伤修复系统的启动。受损细胞的转归,在很大程度上,取决于 DNA 损伤的修复效果,如损伤被正确修复,细胞的 DNA 的结构恢复正常,细胞就能够维持正常状态;如损伤严重,DNA不能被有效修复,则可能通过凋亡的方式,清除这些 DNA 受损的细胞,降低 DNA 损伤对生物体遗传信息稳定性的影响。另外,当 DNA 的损伤发生不完全修复时,DNA 发生突变,染色体发生畸变,可诱导细胞出现功能改变,甚至出现衰老、细胞恶性转化等生理病理变化。如果遗传物质具有绝对的稳定性,那么生物将失去其进化的基础,就不会呈现大千世界、万物生辉的自然景象。因此,自然界生物的多样性 依赖于 DNA 损伤与 DNA 损伤修复之间的良好平衡。 轮虫以极强的抗逆性(如隐生现象)闻名,其在极端干燥环境下DNA会断裂成碎片,但通过高效的修复机制,在复水后能重新组装DNA并复活。这种机制包括依赖DNA连接酶等酶类修复断裂,使其能在短时间内重塑遗传物质完整性。
关键点: - 抗逆机理: 轮虫在干燥时进入休眠,DNA虽断裂,但细胞内存在特殊保护物质(如海藻糖)和高效修复酶。
- 修复过程: 复水后,利用细胞内的修复系统,将数千个DNA碎片在短时间内有序连接成完整染色体。
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